Vai direttamente ai contenuti della pagina

LADE
Laboratorio di Data Engineering

LADE

Un’infrastruttura avanzata per la ricerca scientifica orientata ai dati 

L’infrastruttura di ricerca all’avanguardia del LADE è dedicata al calcolo ad alte prestazioni e all’intelligenza artificiale applicati alla ricerca scientifica. Collaborando con laboratori sperimentali che spaziano dalla biologia alla scienza dei materiali, i nostri ricercatori sviluppano e implementano algoritmi integrando conoscenze provenienti da dati eterogenei. 

Il laboratorio di ricerca include personale ricercatore, numerosi post-doc e dottorandi, e vanta una vasta gamma di background che comprendono matematica, fisica, bioinformatica, ingegneria e informatica. Promuoviamo programmi di visiting per ricercatori senior e stage per giovani ricercatori. 

Il gruppo gode di una collaborazione con due strutture sperimentali all’interno dell’Area Science Park, LAGE e LAME. Inoltre, mantiene forti relazioni con varie istituzioni locali, come UniTS, SISSA, ICTP, ICGEB, IRCCS Burlo Garofalo, CRO, e dispone di una vasta rete di collaborazioni in tutta Europa, tra cui Spagna, Paesi Bassi, Regno Unito e molti altri Paesi. 

Linee di ricerca

La ricerca presso il LADE è organizzata in tre tematiche principali: intelligenza artificiale, ecosistemi di dati e calcolo ad alte prestazioni. Integrando queste aree, adottiamo un approccio olistico ai dati scientifici, estraendo informazioni significative e consentendo una comprensione completa e un efficace controllo dei modelli costruiti su questi dati. 

La ricerca sull’IA presso LADE si concentra sul rendere i modelli di machine learning più interpretabili, in particolare attraverso l’analisi delle rappresentazioni dei dati. Usiamo queste analisi per migliorare l’applicabilità dell’IA in diversi ambiti scientifici come la biologia e la scienza dei materiali. 

  • Fondamenti dell’Intelligenza Artificiale
    Avanzamento dell’interpretabilià dei transformer e dei modelli multimodali attraverso l’analisi geometrica e topologica dei dati, e tramite l’interpretabilità meccanicistica, per guidare i processi sottostanti che determinano le decisioni dei modelli. 
  • IA per Macromolecole Biologiche, Biologia Strutturale e Genomica
    Sfruttamento della potenza dei transformer per prevedere e modellare le proprietà, l’evoluzione e le interazioni di proteine, RNA e DNA, con un focus su biologia strutturale, genomica e studi sull’evoluzione del cancro. 
  • IA per le Scienze dei Materiali
    Ottimizzazione degli esperimenti di scienza dei materiali tramite calibrazione automatica delle immagini, denoising e rimozione del background nei dati spettroscopici. 

Le attività di LADE nella gestione dei dati scientifici mirano a raggiungere l’interoperabilità tra esperimenti, enfatizzando soluzioni pratiche e collaborando direttamente con laboratori sperimentali nelle scienze della vita e dei materiali. 

Linee di ricerca:

  • Integrazione FAIR di dati multi-omici nei laboratori di scienze della vita
    Sviluppo di modelli di dati comuni standardizzati e ontologie per ottenere interoperabilità tra dati multimodali delle scienze della vita, dagli omics all’imaging. 
  • Ecosistemi digitali per la ricerca
    Implementazione di un’adeguata archiviazione dati, tracciabilità completa e disponibilità dei dati per la ricerca fondamentale, promuovendo nuove scoperte e la riproducibilità. 
  • Pipeline HPC e IA
    Integrazione e cura di dataset scientifici da utilizzare in pipeline HPC altamente automatizzate, specialmente con nuove tecniche di intelligenza artificiale. 

LADE gestisce e mantiene ORFEO, l’infrastruttura HPC e di storage di ultima generazione, progettata per adattarsi rapidamente agli scenari in continua evoluzione di calcolo e archiviazione. 

Linee di ricerca: 

  • Infrastruttura come piattaforma di ricerca
    Progettazione di workflow computazionali per progetti di ricerca, integrando l’approccio HPC tradizionale con le tecnologie cloud emergenti.
  • Monitoraggio e ottimizzazione del consumo energetico
    Sviluppo di metodi per analizzare il consumo energetico dei workflow HPC, al fine di creare modelli per ottimizzare calcolo, storage e trasferimento dati.
  • HPC per applicazioni di IA
    Realizzazione di ambienti e framework di test per piccole e medie imprese interessate a digitalizzazione e sviluppo di soluzioni IA nelle loro attività. 
INFRASTRUTTURE
Il Data center – ORFEO

ORFEO (Open Research Facility for Epigenomics and Other) è il nostro data center modulare ad alte prestazioni, progettato per supportare la ricerca scientifica avanzata e l’innovazione industriale. Fornisce milioni di ore di calcolo ogni anno e gestisce carichi di lavoro HPC e AI con elevata flessibilità e compatibilità cloud.

ORFEO offre:

  • Infrastruttura computazionale per AI e Data Science, a supporto delle ricerche condotte presso LADE e in collaborazione con enti esterni
  • Ospitalità dati e gestione di repository, in linea con i principi FAIR
  • Ottimizzazione energetica dell’infrastruttura
  • Soluzioni personalizzate per la ricerca industriale, incluse consulenze specialistiche, simulazioni e supporto alle PMI

Disponibile come IaaS, PaaS e SaaS, ORFEO è strettamente integrato con enti e istituzioni esterne e supporta l’elaborazione dei dati generati dagli Open Lab  Scienze della Vita e Materiali Innovativi..

Progetti di ricerca

Esplora le linee e le attività di ricerca di Area Science Park

Pubblicazioni scientifiche

Accedi all’archivio di articoli e studi pubblicati dai ricercatori di Area Science Park.

Unisciti a noi

In Area Science Park le menti brillanti e determinate sono sempre le benvenute! Entra nel nostro team e lavora in un ambiente dinamico e collaborativo, contribuisci al progresso scientifico che stiamo generando.

Team LADE

Cazzaniga Alberto
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Responsabile ufficio
Ansuini Alessio
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Basile Lorenzo
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Bazzocchi Federica
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Biagetti Matteo
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Cuturello Francesca
Ufficio Laboratorio Data Engineering
de Luca Mariarita
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Doimo Diego
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Fabris Fiorella
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Lot Ruggero
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Luin Massimo
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Ortu Francesco
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Panizon Emanuele
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Piomponi Valerio
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Prenassi Marco
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Rodani Tommaso
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Valeriani Lucrezia
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Villegas Garcia Edith Natalia
Ufficio Laboratorio Data Engineering
Zagni Cecilia
Ufficio Laboratorio Data Engineering

Calendario dei seminari scientifici

Partecipa ed entra in contatto con una comunità di ricerca che cresce e si confronta

Per informazioni e accesso alla strumentazione