13/03/2020
EXSCALATE4CoV, il progetto europeo per contrastare il Covid-19 con il supercalcolo
18 i partner da 7 Paesi europei tra cui Elettra Sincrotrone Trieste
I Nostri Campus - Diagnostica
EXSCALATE4CoV, il progetto europeo per contrastare il Covid-19 con il supercalcolo
La Commissione Europea ha lanciato EXSCALATE4CoV, progetto per combattere la diffusione di COVID-19. L’obiettivo di E4C è duplice:
• identificare molecole terapeuticamente efficaci contro il COVID-19
• sviluppare e consolidare nel tempo uno strumento efficace per contrastare future epidemie virali.
Il progetto è attivo dalla seconda metà di febbraio a seguito di un bando della Commissione Europea, emanato con carattere d’urgenza. Il consorzio pubblico-privato è composto da 18 beneficiari di 7 Paesi europei. Tra i partner italiani, Elettra Sincrotrone Trieste, il centro di supercalcolo Cineca, l’Istituto Nazionale per le Malattie Infettive Spallanzani ed il coordinatore Dompè Farmaceutici S.p.A.
Il progetto si basa sulla piattaforma EXSCALATE (EXaSCale smArt pLatform Against paThogEns), attualmente la più potente ed efficiente piattaforma di calcolo intelligente al mondo, sviluppata da Dompè. Il team di Elettra, guidato da Paola Storici, si concentrerà sullo studio di proteine, contribuendo alla progettazione razionale di nuove molecole potenziali farmaci e a convalidare i modelli virtuali originati dalla piattaforma EXSCALATE. Il progetto EXSCALATE4CoV sfrutterà le più potenti risorse di calcolo attualmente disponibili in Europa, per rafforzare lo sviluppo di farmaci intelligenti. Il progetto seguirà due linee di lavoro altamente interconnesse. La prima si avvarrà di tecnologie ed algoritmi bio-informatici e chimico-informatici, mentre la seconda sarà focalizzata su un approccio genomico, biochimico e biologico.
Il laboratorio di biologia strutturale di Elettra e le linee di luce XRD1 e XRD2, dedicate alla bio-cristallografia, saranno impegnate nella determinazione delle strutture delle proteine bersaglio per i potenziali farmaci. Più nel dettaglio, il lavoro di Elettra non prevede l’utilizzo di virus o assemblati virali potenzialmente patogeni, ma si concentrerà esclusivamente sull’utilizzo di proteine ricombinanti. Tali proteine sono del tutto analoghe a quelle correntemente espresse ed analizzate ad Elettra, con la competenza scientifica che ha indotto a richiederne un considerevole apporto al progetto. Le proteine in questione saranno dunque cristallizzate e caratterizzate strutturalmente per studiare le proprietà di legame con le molecole proposte quali potenziali farmaci, al fine di comprendere siti e modalità di interazione, ed identificare così le linee terapeutiche potenzialmente più efficaci nella lotta contro il COVID-19.

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